Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx2P80206 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx2P80206 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx2P80206 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Otx2P80206 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms