Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sparcl1P70663 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms