Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NfixP70257 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NfixP70257 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfixP70257 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfixP70257 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfixP70257 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfixP70257 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfixP70257 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfixP70257 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfixP70257 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfixP70257 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NfixP70257 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NfixP70257 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfixP70257 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfixP70257 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NfixP70257 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfixP70257 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfixP70257 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfixP70257 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfixP70257 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfixP70257 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms