Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbdsP70122 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SbdsP70122 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms