Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcbp1P60335 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcbp1P60335 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcbp1P60335 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcbp1P60335 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcbp1P60335 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcbp1P60335 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcbp1P60335 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcbp1P60335 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcbp1P60335 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcbp1P60335 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcbp1P60335 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcbp1P60335 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcbp1P60335 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcbp1P60335 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcbp1P60335 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcbp1P60335 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcbp1P60335 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcbp1P60335 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcbp1P60335 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms