Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dpf3P58269 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms