Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gp1bbP56400 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gp1bbP56400 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms