Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp5P56399 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp5P56399 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp5P56399 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp5P56399 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms