Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc12a1P55014 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms