Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ephb3P54754 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb3P54754 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ephb3P54754 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ephb3P54754 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms