Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RabggtbP53612 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RabggtbP53612 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RabggtbP53612 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RabggtbP53612 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RabggtbP53612 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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RabggtbP53612 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RabggtbP53612 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RabggtbP53612 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RabggtbP53612 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RabggtbP53612 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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