Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp1P52624 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upp1P52624 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Upp1P52624 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 517.6 ms