Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxc13P50207 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms