Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptx3P48759 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms