Protein–RNA interactions for Protein: P42859

Htt, Huntingtin, mousemouse

Predictions only

Length 3,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HttP42859 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HttP42859 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HttP42859 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HttP42859 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HttP42859 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HttP42859 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HttP42859 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HttP42859 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HttP42859 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HttP42859 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HttP42859 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HttP42859 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HttP42859 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HttP42859 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HttP42859 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HttP42859 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HttP42859 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HttP42859 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HttP42859 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HttP42859 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HttP42859 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HttP42859 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HttP42859 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms