Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rpl28P41105 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rpl28P41105 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
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