Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtlP38585 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtlP38585 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtlP38585 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TtlP38585 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TtlP38585 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TtlP38585 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TtlP38585 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TtlP38585 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TtlP38585 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TtlP38585 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TtlP38585 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtlP38585 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms