Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rfc1P35601 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms