Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nedd1P33215 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms