Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc1P29341 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms