Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa2P28309 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa2P28309 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa2P28309 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa2P28309 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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