Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CftrP26361 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CftrP26361 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CftrP26361 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CftrP26361 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CftrP26361 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CftrP26361 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CftrP26361 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CftrP26361 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CftrP26361 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CftrP26361 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CftrP26361 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CftrP26361 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CftrP26361 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CftrP26361 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CftrP26361 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CftrP26361 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CftrP26361 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CftrP26361 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CftrP26361 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CftrP26361 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CftrP26361 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CftrP26361 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CftrP26361 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CftrP26361 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CftrP26361 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CftrP26361 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CftrP26361 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CftrP26361 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CftrP26361 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CftrP26361 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CftrP26361 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CftrP26361 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CftrP26361 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CftrP26361 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CftrP26361 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CftrP26361 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CftrP26361 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CftrP26361 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CftrP26361 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CftrP26361 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CftrP26361 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CftrP26361 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CftrP26361 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CftrP26361 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CftrP26361 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CftrP26361 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CftrP26361 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CftrP26361 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CftrP26361 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CftrP26361 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CftrP26361 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CftrP26361 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CftrP26361 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CftrP26361 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CftrP26361 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CftrP26361 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CftrP26361 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CftrP26361 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CftrP26361 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CftrP26361 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CftrP26361 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CftrP26361 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CftrP26361 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms