Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ctnna1P26231 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms