Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Eif3aP23116 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eif3aP23116 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms