Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnc2P20801 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc2P20801 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms