Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkcaP20444 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms