Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NefhP19246 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NefhP19246 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NefhP19246 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NefhP19246 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NefhP19246 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NefhP19246 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NefhP19246 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NefhP19246 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NefhP19246 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NefhP19246 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NefhP19246 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NefhP19246 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NefhP19246 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NefhP19246 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NefhP19246 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NefhP19246 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NefhP19246 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NefhP19246 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NefhP19246 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NefhP19246 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NefhP19246 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NefhP19246 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NefhP19246 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NefhP19246 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NefhP19246 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NefhP19246 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NefhP19246 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NefhP19246 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NefhP19246 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NefhP19246 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NefhP19246 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NefhP19246 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NefhP19246 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NefhP19246 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NefhP19246 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NefhP19246 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NefhP19246 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NefhP19246 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NefhP19246 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NefhP19246 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NefhP19246 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NefhP19246 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NefhP19246 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms