Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ass1P16460 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ass1P16460 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ass1P16460 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ass1P16460 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms