Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
P10404 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
P10404 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
P10404 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
P10404 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
P10404 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
P10404 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
P10404 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
P10404 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
P10404 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
P10404 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
P10404 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms