Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a2P08122 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms