Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01757 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01757 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01757 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01757 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01757 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01757 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01757 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01757 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01757 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01757 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01757 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01757 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01757 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01757 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01757 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01757 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01757 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01757 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01757 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01757 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01757 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01757 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01757 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01757 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P01757 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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P01757 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01757 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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P01757 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01757 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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