Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnkO88874 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CcnkO88874 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcnkO88874 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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