Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms