Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd46O88174 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd46O88174 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd46O88174 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd46O88174 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms