Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lnx1O70263 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms