Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnk2O54967 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnk2O54967 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnk2O54967 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnk2O54967 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnk2O54967 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnk2O54967 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnk2O54967 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnk2O54967 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnk2O54967 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnk2O54967 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnk2O54967 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnk2O54967 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnk2O54967 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnk2O54967 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnk2O54967 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnk2O54967 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnk2O54967 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnk2O54967 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnk2O54967 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnk2O54967 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnk2O54967 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnk2O54967 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnk2O54967 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnk2O54967 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnk2O54967 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnk2O54967 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnk2O54967 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnk2O54967 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnk2O54967 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnk2O54967 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnk2O54967 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnk2O54967 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnk2O54967 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnk2O54967 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnk2O54967 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnk2O54967 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnk2O54967 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnk2O54967 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms