Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2f6O54917 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms