Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb3O54890 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms