Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Limk2O54785 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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