Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrxO54751 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrxO54751 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrxO54751 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CrxO54751 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CrxO54751 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CrxO54751 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CrxO54751 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CrxO54751 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CrxO54751 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrxO54751 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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