Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Abcc1O35379 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Abcc1O35379 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Abcc1O35379 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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