Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dgcr6O35347 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Dgcr6O35347 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Dgcr6O35347 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dgcr6O35347 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dgcr6O35347 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dgcr6O35347 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
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Dgcr6O35347 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dgcr6O35347 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dgcr6O35347 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dgcr6O35347 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dgcr6O35347 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Dgcr6O35347 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dgcr6O35347 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dgcr6O35347 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dgcr6O35347 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dgcr6O35347 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dgcr6O35347 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dgcr6O35347 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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Dgcr6O35347 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Dgcr6O35347 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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Dgcr6O35347 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Dgcr6O35347 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Dgcr6O35347 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Dgcr6O35347 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Dgcr6O35347 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Dgcr6O35347 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Dgcr6O35347 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Dgcr6O35347 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Dgcr6O35347 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Dgcr6O35347 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Dgcr6O35347 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms