Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sh2d1bO35324 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms