Protein–RNA interactions for Protein: O35218

Cpsf2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf2O35218 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpsf2O35218 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpsf2O35218 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpsf2O35218 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpsf2O35218 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpsf2O35218 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpsf2O35218 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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