Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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