Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3336J3QMQ6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms