Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21897J3KMP5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms