Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Arfgef1G3X9K3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arfgef1G3X9K3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms