Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Arid4aF8VPQ2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms