Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Crocc2F6XLV1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms